El cáncer gástrico y las ómicas

El cáncer gástrico y las ómicas

Resumen

El cáncer gástrico es un proceso fatal cuyos factores de riesgo incluyen la infección por Helicobacter pylori, la anemia perniciosa, la ingesta de compuestos nitrosos, el abuso de alcohol, el tabaquismo y el sexo masculino. El seguimiento endoscópico ha definido la progresión histológica de lesiones premalignas a lesiones malignas. Sin embargo, los tumores gástricos exhiben diferentes y muy variadas variaciones histológicas, comportamientos clínicos y respuestas a tratamiento. Esta gran heterogeneidad intrapaciente e interpaciente ha obligado a la búsqueda de principios reguladores que gobiernen la evolución del cáncer gástrico. Los programas avanzados de bioinformática, la tecnología de microarreglos de ADN y la genómica funcional han ayudado a integrar la estructura, función y dinámica de moléculas biológicas expresadas o secretadas por las células epiteliales cancerosas que han modificado la clasificación del cáncer gástrico.

Introducción

El cáncer gástrico es una de las principales causas de morbilidad y mortalidad por cáncer a nivel mundial 1 . Presenta altos niveles de variación histológica, transcriptómica y epigenómica con comportamientos clínicos y respuestas al tratamiento diferenciados 2 pero la comprensión de la biología de los tumores gástricos y los principios clave que rigen la evolución del cáncer gástrico están lejos de ser comprendidos. La vía de Correa de la carcinogénesis gástrica describe la progresión histológica de los epitelios gástricos normales hacia el cáncer gástrico 3pero la aparición de la tecnología de microarrays de ADN y el establecimiento de la genómica funcional han modificado la clasificación del cáncer gástrico. La caracterización de esta nueva forma de estudiar e integrar la estructura, función y dinámica de las moléculas biológicas se ha incorporado al concepto ómico. El objetivo del concepto ómico es examinar los cambios celulares implicados en las características del cáncer utilizando técnicas como la secuenciación de próxima generación y las técnicas de espectrometría de masas. El objetivo inicial es identificar alteraciones de los genes asociados con el control del crecimiento celular, como los oncogenes, los genes supresores de tumores y los genes cuidadores, para determinar (a) la inestabilidad genómica, ya sea que haya cambios estructurales cromosómicos equilibrados, cambios estructurales no recíprocos o código genético alterado de ciertos genes, o (b) la inestabilidad epigenómica secundaria a la metilación del ADN -asociada al silenciamiento transcripcional de genes y/o activación de oncogenes-, la modificación de histonas -que determina la activación o represión génica-, o el efecto del ARN no codificante cuyo papel depende de su interacción con el ARN, el ADN o las proteínas. Varios de estos cambios en el material genético pueden ocurrir simultáneamente. Sin embargo, la regulación génica en el cáncer es un tema de gran actualidad. Las ramas de investigación a las que se refiere el concepto ómico incluyen varias disciplinas biológicas que, en general, intentan identificar, caracterizar y cuantificar las moléculas biológicas que intervienen en la estructura, función y dinámica de una célula o un tejido. Los objetos de estudio abarcan: (1) genómica, la integración de todas las disciplinas relacionadas con el estudio y aplicación de los genomas, (2) epigenómica, el estudio de las modificaciones reversibles en el genoma que afectan la expresión génica sin alterar la secuencia de ADN, (3) transcriptómica, el análisis de mensajeros y transcritos de ARN no codificantes producidos por el genotipo en un momento dado, (4) proteómica, el estudio a gran escala de la estructura y función de las proteínas, (5) metabolómica, el estudio de los procesos químicos que involucran metabolitos, sustratos de moléculas pequeñas e intermediarios, (6) secretómica, el análisis de todas las proteínas secretadas de una célula, se considera como un tipo de proteómica, (7) interactómica, el estudio de todo el conjunto de interacciones moleculares en un sistema biológico, (8) metagenómica, el estudio de la estructura y función de secuencias completas de nucleótidos recuperadas de organismos, (9) lipidómica, el estudio de la estructura, función e interacción de las moléculas lipídicas con otras lípidos y proteínas, (10) glicómica, el estudio de las funciones biológicas de cualquier estructura de carbohidrato producida por una célula o tejido en condiciones específicas, y (11) inmunómica, el estudio del mapa detallado de las reacciones inmunes de un huésped que interactúa con un antígeno extraño.

Sanyog Dwivedi, Luis F. Montaño-Estrada, Erika P. Rendón-Huerta

Facultad de Medicina, Departamento de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Inmunobiología, UNAM, Ciudad de México, México

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